又稱手性原子。為連接有四個不同的原子或原子團的原子。不對稱碳原子連有四個不同原子或原子團,它的四面體結構有兩種形式,彼此互為實物與鏡像的關係,即相互對映,不能重疊。例如,乳酸分子CH3

HOHCOOH的中心碳原子就是一個不對稱碳原子(通常標以星號),它有以下兩種對對映體:

  隻含有一個不對稱碳原子的化合物,一定是旋光性(見旋光異構)的。當含有矽、鍺、氮(季銨鹽或氮的氧化物)或某些金屬如錳、銅、鈹和鋅等的化合物中的這些原子連有四個不同的原子或原子團,而其四個價鍵指向四面體的四個頂端時,則所生成的化合物均為旋光性的。在砜類中硫以四面體鍵合,因有兩個原子團同為氧,無旋光性。

  當以角錐形鍵合的原子連有三個不同的原子或原子團時,則未共用電子對可視為第四個原子團,可能具有旋光性。亞砜、亞磺酸酯、锍鹽和亞硫酸酯中的硫以角錐形鍵合,以下一些例子皆已拆分:

  當氮原子位於一個化合物的橋頭時,由於不能發生反轉,如果這些分子是手性的,也能拆分,例如光學活性的特勒格爾(Tröger)堿:

磷的構型反轉慢,砷的構型反轉更慢,非橋頭的光學活性磷、砷化合物已經拆分。