消化道的起始部，前自口孔開始，後至咽部終止。口腔前端的粘膜上皮是外胚層，其餘部分是內胚層。口腔內包括牙齒、舌及口腺3種主要結構。圓口類缺少上下頜（故又稱無頜類），其圓形的口漏鬥從不關閉，口位於口漏鬥深處。魚類有瞭能活動的上頜和下頜，由上下頜限制著口腔，故魚類以上的各類脊椎動物又總稱為有頜類。在進化史上，隨著頜的出現產生瞭牙齒，使動物能主動捕、咬和咀嚼食物，增強瞭獲得食物的機會，提高瞭食物利用率(見消化)。多數低等有頜類，口緣圍以表皮皺襞。龜類、鳥類及單孔類類的口緣為表皮的角質喙，哺乳動物的口緣圍以肌肉質的唇，是對吸吮乳汁的適應。兩棲類的口腔頂部前方有一對內鼻孔，使口腔成為食物和空氣的共同通路。羊膜動物的口腔頂壁出現瞭次生骨質腭，將原來的口腔分為背部的空氣通路──鼻腔和腹部的口腔。哺乳類在硬腭之後出現肌肉質的軟腭，內鼻孔也相應地後移，使空氣通路和食物通路分開；口腔充盈食物時，並不妨礙呼吸。
牙齒 牙齒最初的功能隻是捕咬食物，哺乳類的牙齒分化兼有切割、刺穿、撕裂和研磨等多種功能。
軟骨魚的牙齒著生於上下頜邊緣的皮膚上，與頜軟骨不直接相連，牙齒數目多，前後數排，形狀大小相同（同型齒），脫落後新牙再長出（多出齒）。鯊魚的牙齒是頜邊的楯鱗加大並彎向內形成的。泥盆紀的裂口鯊，體表已有楯鱗，嘴邊成排加大的楯鱗則為咬捕食物之用，代表著原始牙齒的出現。牙齒和楯鱗是同源器官，在個體發生上兩者同是由外胚層的釉質和中胚層的齒質構成，中央為髓腔，有神經和血管通入腔內。
硬骨魚和兩棲類的牙齒著生的部位較廣泛，除著生於頜骨上，也常著生在鋤骨，腭骨、副蝶骨，甚至咽弓上。牙齒一般著生在頜骨頂端，即端生齒，如硬骨魚，但也有著生在頜骨的內側面，即側生齒如大鯢。
爬行類的牙齒著生於上下頜緣，也有著生於腭骨和翼狀骨上的，經常脫落更換。龜與鱉不具牙齒，而代之以角質鞘。牙齒除端生齒和側生齒外，還有槽生齒，著生在頜骨的齒槽內，如鱷和哺乳類。槽生齒比較牢固，是一個很大的進步。毒蛇在其上頜的牙齒中，有數齒（一般為2齒）變成為具有溝或管的毒牙。毒牙的基部通過導管與毒腺相連，咬噬時註毒液入傷口。毒牙後面常有後備牙，當前面的毒牙脫落時，後備牙就遞補上去。在閉口時，毒牙向後臥倒。在咬噬時，由特殊肌肉收縮使之豎立。
現代鳥類皆無齒，但化石鳥有齒，如始祖鳥、黃昏鳥等。
哺乳類牙齒的特點是：①再生齒，即一生僅換一次牙，乳齒脫落後換出恒齒（少數種類，如齒鯨、單孔類、海牛等是一次出齒，不換恒齒）；②槽生齒，每一齒皆著生於單獨的齒槽內；③異型齒，分為門齒、犬齒、前臼齒和臼齒。分別為切斷、刺穿和研磨食物之用。哺乳類同一種獸類的牙齒分化的形狀和數目皆相同，可以列成齒式。如兔的齒式
表示：上頜每側有2個門齒、無犬齒、3個前臼齒、3個臼齒，下頜每側有1個門齒、無犬齒、2個前臼齒、3個臼齒，合起來乘以2，即為總數28。豬的齒式是
；人的齒式是
。
哺乳類的牙齒可以分為食蟲型、食肉型、食草型和雜食型四種。食蟲型門齒尖銳，犬齒不發達，臼齒齒冠上有銳利的齒尖，齒尖圖案多呈“W”型；食肉型門齒較小，少變化，犬齒特別發達，臼齒常有尖銳的突起，上頜最後一個前臼齒和下頜第一臼齒特別增大，齒尖鋒利用以撕裂肉，稱為裂齒。食草型犬齒不發達或缺如，門齒和前臼齒間常具寬闊齒隙，稱齒虛位，臼齒扁平，咀嚼面寬闊，齒冠高。雜食型的臼齒齒冠多為丘形隆起。
哺乳類的牙齒與食物性質密切相關，而食性又與動物的整體結構有關，因此，牙齒就成為研究動物整體結構與功能的一個重要指標，也是分類鑒定動物的重要依據。牙齒是身體中最堅硬的部分，數目又多，易於在地層上保存成為化石，所以也是古生物學上最有價值的材料。
脊椎動物牙齒進化的一般歷程是：由同型齒列到異型齒；由多出齒到再生齒；由端生齒和側生齒到槽生齒；由數量多而不恒定到數量少而恒定；由著生部位廣泛(上下頜、鋤骨、腭骨、副蝶骨等處)到僅著生於上下頜。
哺乳動物通過咀嚼肌的收縮，可使下頜向上、下、左右及前方運動，上牙列和下牙列互相接觸咬緊，可產生很大的壓力，以磨碎、切割或撕裂食物，便於食物的消化。人齒咬緊時，上、下牙列之間0.5平方厘米的牙面上可有20千克的力。
舌 文昌魚無舌。圓口類的舌象唧筒中的活塞，舌端有角質齒可銼破寄主──魚的皮膚而吸食其血肉。魚類舌由基舌骨支持，舌本身沒有舌內肌，僅能稍作前後挪動用以幫助吞食，但不能作大幅度動作。無尾兩棲類以上，舌有舌內肌，能自由伸縮，舌部有復雜的腺體可分泌粘液粘著昆蟲。爬行類的龜和鱷，舌著生在口腔底，不能向外伸出；有鱗類的舌活動性大，蛇和一些蜥蜴的舌可以伸出很遠。蛇的細長而尖端分叉的舌，俗稱“信子”，總是在不停地吞吐著，回收時，舌尖進入犁鼻器的囊內，囊內壁具有嗅粘膜，有嗅神經的分枝通入可監測舌尖帶入的化學物質；避役的舌極為發達，是特殊的捕食器，平時收縮在口腔內，捕食時迅速伸出，其長度幾與體長相等。鳥類的舌硬，表面被覆角化的上皮，一般不能活動。啄木鳥的舌很長，前端具倒鉤，適於啄取樹木中的昆蟲；蜂鳥的舌前端呈管狀或刷狀，適於啄取花蜜。
哺乳類有發達的肌肉質的舌，能自由活動。舌與食物攪拌、吞咽、吸吮有關。口腔壁肌肉和舌肌收縮可使口腔內空氣壓力降低，從而將液體吸入。哺乳類和人的舌分為舌根、舌體和舌尖三部分。舌根、舌體與口腔底相連，隻有舌尖是遊離的。舌的腹面以舌系帶與口腔底粘膜相連。舌背表面粘膜上有一系列乳頭：絲狀乳頭，蕈狀乳頭、輪廓乳頭和葉狀乳頭。絲狀乳頭數量最多，呈絨毛狀，密佈舌背面；蕈狀乳頭數量較少，形狀如蕈，頂端呈圓形，散在於絲狀乳頭之間；輪廓乳頭僅一對，位於舌根處；葉狀乳頭一對，位於輪廓乳頭的前外側緣，形大，呈長圓形，表面有平行的皺褶。絲狀乳頭為純機械性作用，其他3種乳頭內均有味覺感受器──味蕾。味蕾呈卵圓形花苞樣，由支持細胞和味蕾細胞組成，有味孔通向舌表面。味蕾細胞頂部有味毛伸向味孔，基部與神經纖維緊密相連。溶於唾液的食物作用於味毛，產生神經沖動，由神經纖維傳到中樞，產生味覺。
舌乳頭上皮常角化和脫落，它們與食物殘渣、唾液等混合，在舌粘膜表面形成一層薄苔，稱為舌苔。人的舌苔可因身體情況不同而有不同的顏色變化，觀察舌苔是祖國醫學診斷疾病的一個重要組成部分。
口腺 圓口類有特殊的口腺，其分泌物可以使宿主的血液不凝。魚類口腔內沒有口腺。兩棲類口腔內有分泌粘液的頜間腺，位於前頜骨和鼻囊間。爬行類的口腺發達，包括唇腺、腭腺、舌腺和舌下腺，其分泌物有濕潤食物和粘捕食物的作用；毒蛇的毒腺是變態的唇腺，腺導管通到毒牙的溝或管中。海龜和鱷類的口腺不發達。鳥類依食性而不同，水棲鳥類及生活於沼澤以潮濕食物為食的鳥類，口腺不發達；以幹燥食物為食的鳥類，口腺發達。一般鳥類的唾液僅起潤滑食物的作用，僅食谷物的燕雀類的唾液中有消化酶。
哺乳類的口腺發達，除一些小口腺外，還有耳下腺、頜下腺及舌下腺，兔還另有眶下腺。耳下腺又稱腮腺，位於耳殼基部之腹面前方，為粉紅色腺體，其導管向前橫過咬肌之表面而深入上唇，開口於上頜第二前臼齒的部位。頜下腺位於下頜的腹面兩側，為一對硬實的卵圓形腺體，其導管向前走行在舌下部連接下頜骨聯合縫處，開口入口腔。舌下腺位於接近下頜骨聯合縫處，較小，呈細長條形，有幾條平行的導管開口於舌下部。兔的眶下腺位於眼窩底部。
哺乳類分泌的唾液可以清潔口腔，濕潤食物，溶解食物產生味覺，潤濕口、唇和喉的粘膜有助於發音，唾液淀粉酶可以將淀粉水解成麥芽糖。此外，唾液腺還有排泄某些病毒（如狂犬病毒）和進入體內的重金屬（如汞和鉛等）的功能。