富含錳礦物的化學沉積巖。在其沉積過程中也受到生物化學作用的促進。原生的沉積錳質巖主要是碳酸錳質巖，次生的錳質巖是含氧化錳的錳質巖。沉積錳質巖主要由軟錳礦、硬錳礦、褐錳礦、水錳礦、黑錳礦和菱錳礦等6種含錳礦物組成。此外，常與菱錳礦在一起的還有錳方解石。菱錳礦和錳方解石也可由氧化富集轉變為氧化錳礦石。碳酸鹽錳質巖具泥晶玉細晶結構，與賦存錳質巖的石灰巖的結構一致。次生錳質巖一般呈膠狀結構。錳質巖在賦存巖層中具有條帶狀構造，透鏡體構造，角礫狀構造等。次生充填的氧化化錳可成裂隙充填構造。錳質巖常在淺海和潟湖盆地中形成，在海洋近岸一側的濱後湖盆中最為常見。這種沉積環境中常有藻類、浮遊生物、鈣質殼生物和其他微生物繁殖，促進瞭錳質的交代，形成錳方解石或菱錳礦。錳質巖的原生巖形成於水盆地弱還原的較深水部位；次生巖則是地表或近地表氧化帶溶解碳酸鹽後淋濾沉淀產生的。氧化物型錳質巖有4種產狀：①在淺海或海緣湖盆地內部，沉積於相對較遠岸的一側，成為含有軟錳礦或褐錳礦的錳質頁巖；②在原生碳酸鹽錳質巖的風化帶，由於風化、淋濾而形成次生的氧化錳礦，以混合錳礦物（硬錳礦）為主；③基性巖、超基性鐵鎂質的風化殼之上，呈皮殼狀硬錳礦或錳土等松散沉積物；④分佈於大洋深處的矽鎂質洋殼表面的含錳結核，如太平洋洋底中局部可形成豐富的鐵-錳結核層，每平方米內可包含幾十千克這類鐵-錳結核。錳質巖的主要類型有黑色頁巖型錳質巖、矽質巖型錳質巖、泥晶灰巖型錳質巖、石灰巖、生物石灰巖型錳質巖和風化淋濾型錳土錳質巖。錳質巖是提取錳的原料。