肛管或直腸下端與肛門旁皮膚之間發生的異常通道。為肛管直腸下端和周圍感染的後遺癥。多見於成人，在肛門疾病中是常見病。肛瘺和痔是完全不同的兩種病。
一般肛瘺都有一個內口和一個外口，稱為簡單肛瘺，80％的內口位於齒狀線的後正中處，因為該處隱窩較深，又最易受到糞便的損傷。外口有時能自行閉合，但不久又破潰。陳舊肛瘺，疼痛不明顯，但肛門旁經常有分泌物沾汙內褲。偶爾外口可長期癒合，內口仍存在，即成為單口內瘺，或者內口癒合，外口因瘺管引引流不暢而不愈，變成單口外瘺。
病因和病理 直腸下端和肛管有一些特殊的解剖結構，如直腸柱、肛瓣和隱窩等，在排便時經常受到糞塊的摩擦，發生損傷的機會很大。隱窩內有肛腺的開口，隱窩呈袋狀，易積存糞便，肛腺分泌的粘液也容易引流不暢。直腸和肛管內平時有大量細菌存在。直腸下端和肛管周圍有許多潛在的解剖間隙，充滿脂肪和疏松結締組織。上述這些特點都是為感染創立瞭極為有利的條件，所以感染多來自肛管內。肛門旁皮膚富於毛囊和皮脂腺，皮下脂肪也較厚，加以局部不清潔，內褲摩擦或便後用硬紙揩拭都容易造成表皮損傷，也容易發生與一般的皮膚感染相似的肛周皮下感染，不過這種感染比較淺在，一般不會形成肛瘺。直腸下端和肛管的感染，細菌侵入部位多在齒狀線附近，特別是隱窩，此處即構成瘺管的內口，感染形成膿腫後自行在肛門旁破潰或經手術切開，膿汁排凈，急性炎癥消退後，殘餘的傷口經久不愈，成為瘺管的外口。若內口較大，可有少量的糞便和氣體由外口排出。肛瘺的周圍還可發生新的膿腫，膿腫通過其他表淺的部位破潰，形成新的外口。反復感染可致出現兩個以上的外口，少數情況下也可以有一個以上的內口。這種有兩個以上的外口或內口的肛瘺，稱為復雜肛瘺，值得註意的是約20％的復雜肛瘺為結核性，但已很少見。此外直腸的局限性腸炎也可並發肛瘺，這種病人常有胃腸道其他部位的非特異性炎性病變存在。
診斷 比較容易，在外口和肛門之間，皮下常可觸及硬韌的索條。在多數情況下，外口位於經肛門中心橫線的後方者，其內口在齒狀線的後方，瘺管多呈彎曲走行，而外口位於橫線的前方者，其內口也在前方，瘺管大多短而直，常需借助於由外口註入美藍才能找到內口。
治療 肛瘺很難自愈，需手術治療。肛門周圍膿腫破潰後，應在一個月後急性炎癥完全消退後再行手術。慢性肛瘺急性感染時也不宜手術。手術的原則是充分擴張肛門，找到內口後，將整個瘺管經皮膚完全豁開。可以用手術刀切開，也可以用掛線的方法。掛線實際上是一種慢性切開。在瘺管被掛線勒開的過程中，傷口也隨之愈合。瘺管多數通過括約肌皮下部或是淺部的一部分，切開後不影響肛門括約肌的功能。如為高位肛瘺，則需分期手術或手術切開結合掛線療法，以免一次切斷肛門直腸環。肛瘺手術成功的關鍵在於找到真正的內口，術後妥善換藥也很重要。
預防 定時大便，保持大便通暢，註意肛門清潔衛生，有利於預防肛瘺的發生。