研究有機化合物的來源、製備、結構、性質、應用以及有關理論的科學。又稱碳化合物的化學。一些簡單的碳化合物，如一氧化碳、二氧化碳、碳酸鹽、碳化物和氰化物，習慣上仍歸無機化學領域。
詞源 “有機化學”這一名詞於1806年首次由J.J.貝采利烏斯提出。當時是作為“無機化學”的對立物而命名的。19世紀初，許多化學傢相信，在生物體內由於存在所謂“生命力”，才能產生有機化合物，而在實驗室裏是不不能由無機化合物合成的。1824年，德國化學傢F.維勒從氰經水解制得草酸；1828年他無意中用加熱的方法又使氰酸銨轉化為尿素。氰和氰酸銨都是無機化合物，而草酸和尿素都是有機化合物。維勒的實驗結果給予“生命力”學說第一次沖擊。此後，乙酸等有機化合物相繼由碳、氫等元素合成，“生命力”學說才逐漸被人們拋棄。由於合成方法的改進和發展，越來越多的有機化合物不斷地在實驗室中合成出來，其中，絕大部分是在與生物體內迥然不同的條件下合成出來的。“生命力”學說漸漸被拋棄瞭，“有機化學”這一名詞卻沿用至今。
簡史 有機化學的歷史大致可以劃分為三個時期。
有機化學的萌芽時期 該時期為從19世紀初到1858年提出價鍵概念之前。在這個時期，已經分離出許多有機化合物，制備瞭一些衍生物，並對它們作瞭定性描述。當時的主要問題是如何表現有機化合物分子中各原子間的關系和建立有機化學體系。法國化學傢A.-L.拉瓦錫發現，有機化合物燃燒後產生二氧化碳和水。他的研究工作為有機化合物元素定量分析奠定瞭基礎。1830年，德國化學傢J.von李比希發展瞭碳、氫分析法，1833年法國化學傢J.-B.-A.杜馬建立瞭氮的分析法。以上有機定量分析法的建立使化學傢能夠求得一個化合物的實驗式。
當時在解決有機化合物分子中各原子是如何排列和結合的問題上，遇到瞭很大的困難。最初，有機化學用二元說來解決有機化合物的結構問題。二元說認為一個化合物的分子可分為帶正電荷的部分和帶負電荷的部分，二者靠靜電力結合在一起。早期的化學傢根據某些化學反應認為，有機化合物分子由在反應中保持不變的基團和在反應中起變化的基團按異性電荷的靜電力結合。但這個學說帶來很大的矛盾，例如，那時把苯甲醛寫成(C7H5O)H，把苯甲酰氯寫成(C7H5O)Cl，其中(C7H5O)是共同的不變部分。但是，如果H是帶正電的，怎麼會被帶負電的Cl所取代？如果(C7H5O)在苯甲醛中是帶負電的，在苯甲酰氯中卻變成帶正電的瞭。
類型說由法國化學傢C.-F.熱拉爾和A.洛朗建立。此說否認有機化合物是由帶正電荷和帶負電荷的基團組成，而認為有機化合物是由一些可以發生取代的母體化合物衍生的，因而可以按這些母體化合物來分類。例如，乙烷
屬於氫型
；醇
和醚
屬於水型
；胺
屬於氨型
等。類型說把眾多有機化合物按不同類型分類，根據它們的類型不僅可以解釋化合物的一些性質，而且能夠預言一些新化合物。但類型說未能回答有機化合物的結構問題。
經典有機化學時期 該時期為從1858年價鍵學說的建立到1916年價鍵的電子理論引入（見化學鍵）。1858年德國化學傢F.A.凱庫勒和英國化學傢A.S.庫珀等提出價鍵的概念，並第一次用短劃“-”表示“鍵”。他們認為有機化合物分子是由其組成的原子通過鍵結合而成的。由於在所有已知的化合物中，一個氫原子隻能與一個別的元素的原子結合，氫就選作價的單位。一種元素的價數就是能夠與這種元素的一個原子結合的氫原子的個數。例如，1個氧原子能夠與2個氫原子結合，因此氧是2價的；1個碳原子能結合4個氫原子，因此碳是4價的。凱庫勒還提出在一個分子中碳原子之間可以互相結合這一重要的概念。按照價鍵學說，甲烷和乙烷的結構式如下：
為瞭解釋乙烯C2H4和乙炔C2H2的結構，還提出碳原子之間不僅以單鍵，還可以通過雙鍵、叁鍵互相結合：
通過單鍵結合的稱為飽和化合物，通過雙鍵、叁鍵結合的則稱為不飽和化合物。因此，乙烷是飽和化合物，乙炔是不飽和化合物。凱庫勒還提出苯的結構為
。
在有機化合物分子內，由於碳原子之間可以通過多種形式彼此結合，往往一個實驗式可以代表多種化合物。這種現象稱為異構現象。化學組成相同但結構不同的化合物互為異構體。含碳原子越多的分子，其異構體數目也越多。異構現象是有機化合物數目如此眾多的重要因素。例如符合實驗式C5H12的有三種化合物，它們分別稱為正戊烷、異戊烷和新戊烷，沸點分別為36°C、29.9°C和9.4°C，它們的結構式分別為：
1848年L.巴斯德分離到兩種酒石酸結晶，一種半面晶向左，一種半面晶向右。前者能使平面偏振光向左旋轉，後者則使之向右旋轉，角度相同。在對乳酸的研究中也遇到類似現象。為此，1874年法國化學傢J.-A.勒貝爾和荷蘭化學傢J.H.范托夫分別提出一個新的概念，圓滿地解釋瞭這種異構現象。他們認為：分子是個三維實體，碳的四個價鍵在空間是對稱的，分別指向一個正四面體的四個頂點，碳原子則位於正四面體的中心（圖1）。當碳原子與四個不同的原子或基團連接時，就產生一對異構體，它們互為實物和鏡像，或左手和右手的手性關系（圖2）。這個碳原子稱為不對稱碳原子（或稱手性碳原子），這一對化合物互為旋光異構體。如果 R1＝COOH，R2＝CH3，R3＝H，R4＝OH，則圖2代表乳酸的一對旋光異構體，圖3是它們的平面投影式，也稱為費歇爾式。勒貝爾和范托夫的學說，是有機化學中立體化學的基礎。
1900年第一個自由基──三苯甲基自由基──被發現瞭，這是個長壽命的自由基。不穩定自由基H3C·的存在也於1929年得到瞭證實。
在這個時期，有機化合物在結構測定以及反應和分類方面都取得很大進展。但價鍵隻是化學傢從實踐經驗得出的一種概念，價鍵的本質尚未解決。
現代有機化學時期 在物理學傢發現電子，並闡明原子結構的基礎上，G.N.路易斯等於1916年提出價鍵的電子理論。他們認為：各原子外層電子的相互作用是使各原子結合在一起的原因。相互作用的外層電子如從一個原子轉移到另一個原子，則形成離子鍵；兩個原子如果共用外層電子，則形成共價鍵。通過電子的轉移或共用，使相互作用的原子的外層電子都獲得惰性氣體的電子構型。這樣，價鍵的圖象表示法中用來表示價鍵的短劃“-”，實際上是兩個原子共用的一對電子。例如，按照價鍵的電子理論，甲烷的結構式應寫成左式，不過為瞭方便，仍常寫成右式：
價鍵的電子理論的運用賦予經典的價鍵圖象表示法以明確的物理意義。
1927年以後，W.H.海特勒和F.W.倫敦等用量子力學處理分子結構問題，建立瞭價鍵理論，為化學鍵提出瞭一個數學模型。後來R.S.馬利肯用分子軌道理論處理分子結構，其結果與價鍵的電子理論所得的大體一致，由於計算簡便，解決瞭許多當時不能回答的問題。對於復雜的有機化合物分子，要得到波函數的精確解是很困難的。E.休克爾假定，在一個共軛體系中，π電子體系可以單獨處理，從而創立瞭一種波函數的近似解法，而為有機化學傢廣泛采用。60年代，在大量有機合成反應經驗的基礎上，R.B.伍德沃德和R.霍夫曼領會到化學反應與分子軌道的聯系，他們研究瞭電環化反應、σ鍵遷移重排和環加成反應等（過去統稱為協同反應）一系列反應，提出瞭分子軌道對稱守恒原理。福井謙一提出瞭前線軌道理論。
這個時期的成就還有取代基效應、線性自由能關系和構象分析等。
元素周期表
特點 有機化合物和無機化合物之間沒有絕對的分界。有機化學之所以成為化學中的一個獨立學科，是因為有機化合物確有其內在的聯系和特性。位於周期表(見彩圖）當中的碳元素，一般是通過與別的元素的原子共用外層電子而達到惰性氣體的電子構型的。例如甲烷分子CH4是由一個C原子和4個H原子共用它們的外層電子而形成的（圖4）。這種共價鍵的結合方式決定瞭有機化合物的特性。大多數有機化合物由碳、氫、氮、氧幾種元素構成，少數還含有鹵素和硫、磷等元素。在含多個碳原子的有機化合物分子中，碳原子互相結合形成分子的骨架，別的元素的原子就連接在該骨架上。在元素周期表中，沒有一種別的元素能像碳那樣以多種方式彼此牢固地結合。由碳原子形成的分子骨架有多種形式，有直鏈、支鏈、環狀等。其構成的碳原子數可從2（乙烷）到幾十萬（橡膠）。以含5個碳原子的化合物為例，其分子骨架可有以下幾種形式：
分子中含碳原子數越多，結合方式的變化也越大。因此，為數不多的幾種元素，卻構成瞭數目驚人的有機化合物。
大多數有機化合物具有熔點較低、可以燃燒、易溶於有機溶劑等性質，與無機化合物的性質不同。
有機化學的研究對象和有機化學工業原料 在有機化學發展的初期，有機化學工業的主要原料是動、植物體，有機化學主要研究從動、植物體中分離有機化合物。19世紀中到20世紀初，有機化學工業逐漸變為以煤焦油為主要原料。合成染料的發現，使染料、制藥工業蓬勃發展，推動瞭對芳香族化合物和雜環化合物的研究。30年代以後，以乙炔為原料的有機合成興起。40年代前後，有機化學工業的原料又逐漸轉變為以石油和天然氣為主，發展瞭巨大的合成橡膠、合成塑料和合成纖維工業。由於石油資源將日趨枯竭，以煤為原料的有機化學工業必將重新發展。當然，天然的動、植物和微生物體仍是重要的研究對象。
有機化學的主要分支學科及其發展 天然有機化學主要研究天然有機化合物的組成、合成、結構和性能。20世紀初至30年代，先後確定瞭單糖、氨基酸、核苷酸、牛膽酸、膽固醇和某些萜類的結構，肽和蛋白質的組成；30～40年代，確定瞭一些維生素、甾族激素、多聚糖的結構，完成瞭一些甾族激素和維生素的結構和合成的研究；40～50年代前後，發現青黴素等一些抗生素，完成瞭結構測定和合成；50年代完成瞭某些甾族化合物和嗎啡等生物堿的全合成，催產素等生物活性小肽的合成，確定瞭胰島素的化學結構，發現瞭蛋白質的 α－螺旋結構，DNA的雙螺旋結構；60年代完成瞭胰島素的全合成和低聚核苷酸的合成；70年代至80年代初，進行瞭前列腺素、維生素B12、昆蟲信息素激素的全合成，確定瞭核酸和美登木素的結構並完成瞭它們的全合成等。
有機合成 主要研究從較簡單的化合物或元素經化學反應合成有機化合物。19世紀30年代合成瞭尿素；40年代合成瞭乙酸。隨後陸續合成瞭葡萄糖酸、檸檬酸、琥珀酸、蘋果酸等一系列有機酸；19世紀後半葉合成瞭多種染料；20世紀40年代合成瞭滴滴涕和有機磷殺蟲劑、有機硫殺菌劑、2，4－滴除草劑等農藥；20世紀初，合成瞭606藥劑，30～40年代，合成瞭一千多種磺胺類化合物，其中有些可用作藥物。
元素有機化學 包括金屬有機化學和非金屬有機化學，主要研究金屬、準金屬和非金屬有機化合物。20世紀40年代前，主要是對有機堿金屬、堿土金屬化合物和有機砷、汞、鉛、錫化合物的研究。40年代後，發展到有機硼、磷、氟和稀土金屬化合物。50年代以來，發現瞭零價過渡金屬與芳烴、烯烴和炔烴的π鍵配位化合物。由於對固氮過程的研究，60年代以來又開辟瞭有機鐵鉬硫和鐵硫簇狀有機化合物的研究，還發現瞭一些烴基過渡金屬，它們在有機合成中表現出選擇性、定向性等特點。
物理有機化學 定量地研究有機化合物結構、反應性和反應機理的學科。它是在價鍵的電子學說的基礎上，引用瞭現代物理學、物理化學的新進展和量子力學理論而發展起來的。20世紀20～30年代，通過反應機理的研究，建立瞭有機化學的新體系；50年代的構象分析和哈米特方程開始半定量估算反應性與結構的關系；60年代出現瞭分子軌道對稱守恒原理和前線軌道理論。
有機分析 即有機化合物的定性和定量分析。19世紀30年代建立瞭碳、氫定量分析法；90年代建立瞭氮的定量分析法；有機化合物中各種元素的常量分析法在19世紀末基本上已經齊全；20世紀20年代建立瞭有機微量定量分析法；70年代出現瞭自動化分析儀器。
有機化學的邊緣學科 由於科學和技術的發展，有機化學與各個學科互相滲透，形成瞭許多分支邊緣學科。這裡以“×”表示互相滲透，列舉下面由不同學科和有機化學產生的分支學科。
生物有機化學──生物化學×有機化學
元素有機化學-─無機化學×有機化學
物理有機化學──物理化學（物理學）×有機化學
農業有機化學──農業化學×有機化學
藥物有機化學──藥物化學×有機化學
量子有機化學──量子力學×有機化學
計算機有機化學──計算技術×有機化學
地球有機化學──地質學×有機化學
海洋有機化學──海洋學×生物學×有機化學
有機化學的研究手段 有機化學研究手段的發展經歷瞭從手工操作到自動化、計算機化，從常量到超微量的過程。20世紀40年代前，用傳統的蒸餾、結晶、升華等方法來純化產品，用化學降解和衍生物制備的方法測定結構。後來，各種色譜法、電泳技術的應用，特別是高壓液相色譜的應用改變瞭分離技術的面貌。各種光譜、能譜技術的使用，使有機化學傢能夠研究分子內部的運動，使結構測定手段發生瞭革命性的變化。電子計算機的引入，使有機化合物的分離、分析方法向自動化、超微量化方向又前進瞭一大步。帶傅裡葉變換技術的核磁共振譜和紅外光譜又為反應動力學、反應機理的研究提供瞭新的手段。這些儀器和 X射線結構分析、電子衍射光譜分析，已能測定微克級樣品的化學結構。用電子計算機設計合成路線的研究也已取得某些進展。
有機化學的發展趨勢 首先是研究能源和資源的開發利用問題。迄今我們使用的大部分能源和資源，如煤、天然氣、石油、動植物和微生物，都是太陽能的化學貯存形式。今後一些學科的重要課題是更直接、更有效地利用太陽能。對知之甚久的光合作用做更深入的研究和有效的利用，是植物生理學、生物化學和有機化學的共同課題。有機化學可以用光化學反應生成高能有機化合物，加以貯存；必要時則利用其逆反應，釋放出能量。另一個開發資源的目標是在有機金屬化合物的作用下固定二氧化碳，以產生無窮盡的有機化合物。這幾方面的研究均已取得一些初步結果。
其次是研究和開發新型有機催化劑，使它們能夠模擬酶的高速高效和溫和的反應方式。這方面的研究已經開始，今後會有更大的發展。60年代末，開始瞭有機合成的計算機輔助設計研究。今後有機合成路線的設計、有機化合物結構的測定等必將更趨系統化、邏輯化。
參考書目
邢其毅編：《有機化學》，高等教育出版社，北京，1957。
R.T.Morrison and R.N.Boyd，Organic Chemistry，4th ed.，Allyn &Bacon，Boston，1983.
L.F.Fieser and M.Fieser，Advanced OrganicChemistry，Reinhold Pub.Corp.，New York，1961.
E.H.Rodd，ed.，Chemistry of Carbon Compounds，Elsevier，Amsterdam，1964.
I.L.Finar，Organic Chemistry，6th ed.，Longman Group，London，1973.