原始的已絕滅的裸子植物。可能起源於前裸子植物，始現於晚泥盆世，石炭二疊紀極盛，中生代逐漸衰退，滅絕於白堊紀。
種子蕨類的植物體一般不大，大多數是倚生或攀援的籐本型。也有一部分呈直立的樹蕨狀，不分枝，高可達10米，或為直立粗壯的小喬木。絕大多數種子蕨植物具真蕨植物一樣的大型蕨葉(多為羽狀複葉)及脈序，不同的是在生殖蕨型葉上長有種子和花粉囊，蕨葉的主葉柄常二歧分叉，葉子表面的角質層厚。莖和根的解剖結構既具真蕨綱性狀又具裸子植植物性狀，原生中柱，真式中柱或多體中柱。有髓的莖中髓常較大，皮部粗厚而次生維管組織較薄，次生木質部疏木型，它們與蘇鐵綱的解剖結構最相似，在未曾發現種子前，曾名之為蘇鐵羊齒或蘇鐵蕨(Cycadofilices)。少數類別次生木質部密木型。
花粉囊和胚珠的形式多樣。胚珠具離生珠被。胚珠的結構與蘇鐵綱的種子相似，本綱至今僅發現二例種子中具胚而絕大多數是保存具頸卵器之雌配子體，因此，所謂種子實際上大都是未受精的胚珠。
種子蕨類的分類有不同意見，可作為一個綱屬於裸子植物門，亦可獨立為一個門。種子蕨綱包括9個目：①皺羊齒目，出現於石炭紀；②髓木目，出現於石炭二疊紀；③美籽目，出現於晚石炭世；④蘆薈羊齒目或美籽目，出現於晚泥盆世至早石炭世；⑤開通目，出現於三疊紀至白堊紀；⑥兜狀種子目，三疊紀；⑦盾形種子目，三疊紀；⑧舌羊齒目，出現於二疊紀至三疊紀；⑨大羽羊齒目，出現於二疊紀至早三疊世早期。
古代種子蕨植物除少數發現“種子”(胚珠)外，大多數的蕨型葉按照小羽片（小葉）的形狀、脈序及葉軸的分枝形式，在各種形態屬名下記載，如楔羊齒、脈羊齒、座延羊齒、齒羊齒、畸羊齒、大羽羊齒等。雖然有些形態屬如楔羊齒在種子蕨類和真蕨類都可有這種葉型，但歸入此形態屬名下的種則是客觀存在的，它們在地史時期的分佈中有一定規律，可用於劃分、對比地層確定其時代。