包括食管的畸形、運動失調、炎癥和腫瘤。有些無癥狀或癥狀輕微，對健康影響不大。有些則影響進食，甚至威脅生命。診斷需根據 X射線鋇劑造影、食管壓力測定或食管鏡檢查。對無癥狀或癥狀輕微者無需治療，對影響進食或威脅生命者則需手術治療。
食管畸形 主要有以下幾種：
氣管食管瘺 胚胎期食管發育不全而造成。。最常見的是上段食管呈盲端，下段食管與氣管相連接，或上段食管與氣管相連接，下段食管為盲管，出生後立即發生氣管吸入現象，呼吸困難，喂奶時發生青紫及嗆咳等，較易診斷。另一種為氣管與食管之間有一條瘺管相連接，出生後易屢發肺炎，哭時因空氣通過瘺管進入胃腸道發生腹脹，較難診斷，治療均需手術糾正畸形。
食管蹼或環 胚胎發育過程中的殘遺。蹼較薄，為粘膜層和粘膜下層組成，可發生於食管的任何部位。一個或多個，有時引起吞咽困難。環較厚，由粘膜和肌肉組成，發生於食管與胃的交界處，呈狹窄的細腔，無癥狀或發生間斷的吞咽困難。X射線鋇餐造影可以發現病變，用食管擴張術治療效果滿意。
食管憩室 食管壁上的囊狀外突。由食管壁的一層或多層組成，主要發生在三個部位：①上食管括約肌的上方，又稱岑克爾氏憩室。②下食管括約肌的上方，又稱膈上憩室。此兩種憩室可能由於食管運動失調造成。③食管中點附近，稱牽引憩室。原因尚不肯定，可能為食管壁外的炎癥引起食管壁的反應，造成瘢痕牽引而成。岑克爾氏憩室可滯留大量液體，於夜間平臥時可有大量反流。牽引憩室常無癥狀。偶而因食物滯留產生吞咽困難。診斷依靠X射線鋇餐造影，對癥狀明顯的病列可考慮手術治療。
另一種稱壁內憩室，X射線鋇餐造影可見食管壁有很多小憩室，病理檢查為擴張的粘膜下腺管，所以又稱假憩室病。癥狀為吞咽困難。可用食管擴張術進行治療。
食管運動失調 見食管運動失調。
食管炎癥 見食管炎。
食管腫瘤 良性腫瘤中肌瘤最多見，很少引起癥狀，常為偶然發現，除懷疑為惡性者外，不需治療。脂肪瘤或纖維血管性息肉可發生長蒂和無限增大，突入咽喉部可引起窒息。鱗狀細胞乳頭狀瘤可為多發性，可用內鏡摘除。淋巴管瘤、上皮食管囊腫、炎性假瘤或炎性纖維息肉多無癥狀，不需治療。
惡性腫瘤通常為下述三類：①食管癌。②黑素瘤。表面息肉樣，瘤上可見有灰色區，活組織檢查常對診斷無幫助，長期預後不良，本病少見。③嗜銀細胞瘤。少見，患者多短期內死亡。
食管、胃及其疾病