1980年由國務院批準建立。1988年劃為國傢級自然保護區。位於內蒙古自治區哲裏木盟科爾沁沙地中間地帶,由兩條“入”字形穀峪組成。較大者為大青溝,長約20公裡,深60~100米,溝寬平均350米;較小者為小青溝,長約10公裡,深50~70米,溝均寬350~400米。由於二者深嵌於沙地中,穀深面窄,周圍雖沙丘滾滾,風沙彌漫,晝夜溫差、年溫差都較大,但溝內冬暖夏涼,氣溫變化緩和,適宜植物生長。大青溝有長白區系、內蒙古和華北區系的木本植物106種,草本植物4222種。適應由溝底至溝上氣溫條件的變化,三層植物群落排列有序:①溝底為水曲柳群落,以水曲柳、椿樹居多,黃菠蘿、朝鮮柳相雜,山葡萄、南蛇藤雜生纏繞。②溝坡為蒙古櫟群落,蒙古櫟、櫟桑成蔭,山杏、紫椴穿插,山丁子、花蓋梨伴生。③溝沿為大果榆群落,大果榆為主,色木槭點綴,每到深秋,槭葉盡紅,榆葉轉黃,紅黃相間,景色艷麗。如將三層植物群落按喬、灌、草劃分,由下而上又可清晰地辨別出喬五、灌四、草三等12層植物帶。1982年在大青溝修建瞭旅遊設施,開始接待中外旅遊者。