中國明清時期臺灣島西南岸重要港口航道。位於今臺灣省臺南市安平鎮西北。西連澎湖水道，東接大灣(俗稱“臺江”)，南岸為北線尾島，北岸為加老灣沙洲。因兩岸沙角形似鹿耳，航道狹窄如門而得名。鹿耳門古為臺灣島西南沙洲群中較大的潮汐口，因受潮流沖蝕，遂成為出入大灣的重要港道。港道底部堅石堆積，暗礁盤結，航道險惡曲繞，巨舟不能入，水勢異常，曾有“天險”之稱。南明桂王永曆十五年，即清順治十八年(1661)三月二十三日，民族英雄鄭成功為驅逐荷蘭殖民者，親率戰船數百艘、水師22.5萬人，從金門料羅灣出發，於四月初一晨，駛抵鹿耳門。趁滿潮，依向導，順利進入鹿耳門航道。以一部兵力在北線尾島北岸登陸，控制航道，主力渡過大灣於東岸赤崁以北的禾寮港登陸。歷經8個多月戰鬥，擊敗荷軍。清道光三年(1823)，臺南地區爆發特大洪水，大灣被泥沙淤塞，港道填為平陸，今僅存鹿耳門溪。