在給水系統中對微生物的抑止。例如湖泊、水庫等水源中藻類等浮遊生物的大量繁殖導致原水產生異味，並幹擾水的過濾，於是投加硫酸銅或漂白粉以抑制微生物生長。又如敞開式迴圈冷卻水系統、紙廠迴圈白水系統中真菌、鐵細菌等的大量繁殖，導致設備的腐蝕和管道輸水能力的降低，於是投加氯、氯酚或季銨鹽等藥劑以抑制微生物生長。藥劑的投加常間歇進行。這是因為：①湖泊、水庫加藥後，在一個時期內藥劑並不流失或消失。②在迴圈水系統中藥劑濃度高的水流對抑止設備與管壁面上微生物的生長較為有效，，而同量藥劑的集中投加有助於濃度的提高。敞開式循環冷卻水系統中的微生物問題尤為突出。由於水溫適宜，各種微生物在養料豐富的場合就大量繁殖。例如在陽光照射的池子中生長藻類、在木結構表面真菌侵襲、在鐵管壁面孳生鐵細菌，從而造成木材腐爛、傳熱設備效率降低、管道輸水阻力增大和出現點蝕等一系列問題。因此，微生物控制是敞開式循環冷卻水系統的主要水處理過程之一。