又稱乙型腦炎（乙腦），或流行性腦炎。由披膜病毒科(Togaviridae)黃病毒屬(Flavivirus)日本乙型腦炎病毒引起的一種急性人畜共患疾病。病原體通過蟲媒傳遞。在傢畜中，馬和豬偶可出現臨診癥狀，其他傢畜(牛、羊等)和傢禽大多為隱性感染。廣泛分佈於亞洲地區，日本發現最早(1871)。有明顯的季節性，常於夏末秋初流行。為瞭與冬季流行的一種嗜睡眠性腦炎（甲型腦炎）相區別，故稱乙型腦炎。帶毒傢畜傢禽和野鳥等是傳染源源，其中以豬和馬為最重要的宿主。幾乎所有按蚊屬、庫蚊屬、伊蚊屬的各種蚊子以及庫蠓等均能傳播本病，尤以三帶喙庫蚊最為重要。感染本病病毒的蚊子終身有傳染性。病毒能隨蚊子越冬，還能經卵傳遞，成為次年感染動物和人的來源。本病的季節性特點與媒介昆蟲的活動時期密切相關。病毒可在人血液中復制，然後經血液循環分佈於各臟器，突破血腦屏障，最後到達中樞神經系統。但多數動物感染的病毒僅停留於內臟，不引起神經癥狀，呈現無癥狀感染，以致不易被察覺。動物感染後不論有無癥狀均出現持續3～7天的病毒血癥，成為供媒介昆蟲傳播病毒的來源。
馬乙型腦炎 病馬發高燒，主要表現神經癥狀，以沉鬱型居多數，常見頭偏向一側，作轉圈運動或無目的地向前直走；有時出現後坐現象，嚴重時後肢麻痹，倒地不起。狂暴型較少見。未成年馬、尤其是當年生駒發病多，但流行多呈明顯的散發性。病馬血液內產生中和抗體、血凝抑制抗體和補體結合抗體，可用血清學試驗檢出；分離的病毒也可用這些試驗予以鑒定。為預防本病發生，應用藥物殺滅蚊、蠓，切斷傳播途徑，並在疫區對4個月齡至1歲的馬、騾用福爾馬林滅活的鼠腦或雞胚疫苗，或弱毒疫苗進行預防接種。
豬乙型腦炎 在中國有些地區，豬的乙型腦炎血清陽性率很高（是人乙腦的主要傳染來源），但臨診發病率卻較低。發病時病豬有短暫高燒，精神萎頓、嗜睡，個別豬的後肢呈輕度麻痹。患病懷孕母豬可突然流產，胎兒多死胎或木乃伊胎，但下一次分娩時則多數能產出正常仔豬。患病公豬常在高燒後發生睪丸腫脹，比正常的大0.5～1倍左右，陰囊皮膚發亮、發熱，經2～3天後腫脹漸漸消失，一般預後良好。臨診癥狀與豬佈魯氏菌病很相似，須加區別。有疫苗可供預防接種。