生物的1界。本界成員均屬真核生物，它是真菌的最高分類階元。真菌廣泛分佈於全球各帶的土壤、水體、動植物及其殘骸和空氣中，營腐生、寄生和共生生活。自C.von林奈把生物區分為動物和植物兩界以後的200多年以來，真菌因固著生活和細胞具壁而一直被歸入植物界。從20世紀中葉起，生物學傢認為真菌的起源、組織、營養方式和細胞壁的組分等都與植物不同，把它歸入植物界並不妥當。真菌營養方式是“吸收異養型”，主要作用是分解，它與植物的光合自養和動物的攝食異養，都有著本質的區別。。所以，在近20～30年的4界以上分類系統中，大多將真菌獨立成界（見分類學）。
真菌界以下的分類系統，有的分亞界，有的分門，有的直接分為綱，因作者而異。其中，英國真菌學傢G.C.安斯沃思等人(1973)的分類系統，既照顧瞭傳統習慣，又反映瞭發展趨勢，比較可取（見表）。
幾個真菌分類系統的門和綱