微生物學的1個分支學科。它研究與農業有關微生物的特性、生命活動規律及其作用過程的調控，從而促進農業生產發展。農業微生物學與農業生產實踐密切相關，因而是在農業生產發展的推動下，綜合瞭土壤微生物學、植物病理學、獸醫微生物學（見醫學微生物學）、植物病毒學（見植物病毒）、肥料微生物學、飼料微生物學（見飼料微生物）、食品微生物學以及生物防治等學科而建立並發展起來的。當前，它還沒有一個嚴格的學科界限。

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