按照職能劃分的縱向領導系統和按專案（任務或產品）劃分的橫向領導系統相結合的組織形式。這種縱橫交叉的領導系統構成瞭矩陣結構，故名。又稱任務組織或專案組織（見圖）。矩陣型組織已廣泛運用於行政組織和其他組織。
現代行政組織經常面臨一些非定型、非例行性的任務，涉及眾多的機關或部門，不是哪一個機關或部門可以獨自完成的。為完成這些特別任務，就需要建立非常設的專門任務小組或委員會。它們隨特定的需要而建立，隨特定任務的完成而撤銷。其成員員由各相關的職能機關或部門根據任務的需要配備，隸屬關系仍屬於原單位，並於任務完成後返回。專門任務小組或委員會負責人對特定任務負領導的責任，對整個工作統一協調和指導。相關的職能機關或部門對特定任務不負直接責任，但有義務予以支持與合作。這種組織形式既與單純的職能結構不同，又同單獨建立的專門小組有別。
矩陣型組織的優點是把職能分工與組織合作結合起來，從專項任務的全局出發，促進組織職能和專業協作，有利於任務的完成；把常設機構和非常設機構結合起來，既發揮瞭職能機構的作用，保持常設機構的穩定性，又使行政組織具有適應性和靈活性，與變化的環境相協調；在執行專項任務組織中，有助於專業知識與組織職權相結合；非常設機構在特定任務完成後立即撤銷，可避免臨時機構長期化。缺點是組織結構復雜，各專項任務組織與各職能機構關系多頭，協調困難；專項任務組織負責人的權力與責任不相稱，如果缺乏有力的支持與合作，工作難以順利開展。專項任務組織是非常設機構，該組織的成員工作不穩定，其利益易被忽視，故他們往往缺乏歸屬感和安全感。
矩陣型組織示意圖