北太平洋西緣，日本群島西南端，對馬島與壹歧島之間的水域。日本海通往中國東海、黃海和進出太平洋的要衝，交通戰略位置重要。由東北向西南延伸，長222公裡，最窄處41.6公裡，水深50～100米，最深可達131米。大陸架十分發育，峽底比較平緩。在水深30～50米和90～120米之間，有兩個平坦面，平坦面上多為礫石，特別是從壹歧到沖之島的深平坦面上礫石分佈廣泛。海底大部分為砂質堆積物，可採集到新生代的貝化石。對馬島與九州岸都是沉降式海岸，曲折蜿蜒，礁石、島嶼、港港灣星羅棋佈，有下關、福岡、北九州等天然良港。其中北九州規模最大，是西日本主要國際貿易港，與中國貿易往來頻繁。黑潮的一支海流對馬暖流從東海經海峽北上進入日本海，勢力很強，使海峽氣候溫暖。冬春之際日本海的冰塊與暖流相匯，為漁業最盛期，水產豐富，九州島西北沿海一帶是日本主要漁業基地之一。下關與比田勝間、博多與嚴原間有定期航線。壹歧島、對馬島為日本國定公園、旅遊勝地。